Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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