Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms