Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Smg8Q8VE18 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Smg8Q8VE18 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Smg8Q8VE18 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Smg8Q8VE18 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Smg8Q8VE18 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms