Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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