Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms