Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CipcQ8R0W1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 744.6 ms