Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms