Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms