Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud6bQ8K2H2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms