Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c1Q8K284 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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