Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs1Q8K212 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms