Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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