Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZU6

Pxdc1, PX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pxdc1Q8JZU6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pxdc1Q8JZU6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pxdc1Q8JZU6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms