Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SbsnQ8CIT9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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SbsnQ8CIT9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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SbsnQ8CIT9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms