Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms