Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms