Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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