Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms