Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp1Q8C4U3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms