Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx16Q8C080 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms