Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms