Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp5Q8BX09 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms