Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbrm1Q8BSQ9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms