Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms