Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp54Q8BL06 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms