Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms