Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Susd6Q8BGE4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Susd6Q8BGE4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Susd6Q8BGE4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Susd6Q8BGE4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms