Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms