Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms