Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChfrQ810L3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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