Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms