Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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