Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SnupnQ80W37 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SnupnQ80W37 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SnupnQ80W37 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SnupnQ80W37 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SnupnQ80W37 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SnupnQ80W37 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SnupnQ80W37 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms