Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pnma8aQ80VM8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms