Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms