Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

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Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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