Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms