Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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