Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms