Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms