Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms