Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms