Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms