Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms