Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms