Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slx4Q6P1D7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms