Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Soga3Q6NZL0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Soga3Q6NZL0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Soga3Q6NZL0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Soga3Q6NZL0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Soga3Q6NZL0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Soga3Q6NZL0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Soga3Q6NZL0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Soga3Q6NZL0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Soga3Q6NZL0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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