Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krba1Q6NXZ1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms