Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms