Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms